學生識講「用限制酶剪、用接合酶貼」,但一問「點證明插入成功」就只答「跑電泳」。這一堂要給他們長度證據:酶切位點、片段長度與條帶位置三樣一起讀。
本堂目標 學生能夠:① 順序講出重組 DNA 的五個步驟並指出每步用的酶;② 由質體與插入片段長度推算重組質體與酶切片段長度;③ 讀凝膠電泳圖判斷插入是否成功;④ 用兩正兩反論證基因改造作物的風險。
01 先備知識(開課前 3 分鐘快檢)
以下任何一項未過關,本堂就會卡住,先補該項:
| 技能 |
快檢題 |
過關標準 |
| DNA 結構 |
鹼基配對規則 |
A 對 T、G 對 C |
| 酶的作用 |
限制酶切哪裡 |
特定辨識序列的磷酸二酯鍵 |
| 鹼基比例 |
1 kb 等於多少鹼基對 |
1 000 bp |
02 課堂流程(60 分鐘)
| 時間 |
環節 |
導師做什麼 |
學生做什麼 |
| 0–10 分 |
五步流程 |
剪、貼、送、選、驗 |
學生口述五步 |
| 10–22 分 |
工具酶 |
限制酶、接合酶、反轉錄酶 |
配對三種酶與用途 |
| 22–36 分 |
長度計算 |
插入後總長、酶切片段 |
5.6000000000000005 kb 與兩條片段 |
| 36–48 分 |
凝膠電泳 |
小片段跑得快 |
由條帶位置判插入 |
| 48–56 分 |
應用與倫理 |
胰島素、Bt 作物、基因治療 |
寫出兩正兩反 |
| 56–60 分 |
離場檢查 |
三題收回即批 |
獨立完成 |
03 講解腳本(照著說就可以)
第一幕:重組 DNA 五步:剪、貼、送、選、驗
剪:用限制酶在辨識序列切開質體與目標基因,產生黏性末端。
貼:DNA 接合酶把糖磷酸骨架接回,形成重組質體。
送:熱震或電穿孔把質體送入細菌,提高鈣離子濃度可增加感受態。
選:用抗生素抗性基因篩選,只有帶質體的細菌能在含抗生素培養基生長。
驗:抽質體再酶切,跑凝膠電泳比對條帶長度。
六個鹼基的辨識序列平均每 4⁶ = 4096 bp 出現一次,所以插入位置大致可預測。
導師做法:要學生用五隻手指記五步,每講一步屈一隻,講完再問「邊步用接合酶」。
第二幕:長度計算:用數字驗證插入
質體 4.4 kb 插入 1.2 kb 片段,重組質體 = 4.4 + 1.2 = 5.6000000000000005 kb。
若在插入片段兩側各有一個酶切位點,酶切後得 1.2 kb 與 4.4 kb 兩條帶;沒有插入的質體只會得一條 4.4 kb 帶。
轉化效率:200 個菌落來自 0.1 µg DNA,即 2000 cfu/µg。
PCR 30 個循環,理論上由 1 份模板得 2^30 = 1,073,741,824 份,實際因試劑耗盡遠低於此值。
要學生計:若插入片段反向插入,電泳圖會怎樣?(長度一樣,所以單靠長度看不出方向,要用測序或不對稱酶切)
第三幕:應用與倫理:兩正兩反
醫療:重組胰島素、生長激素、疫苗抗原,純度高、無血源污染風險。
農業:Bt 抗蟲作物減少農藥,黃金米增加維生素 A 前體。
風險:基因漂移至野生近緣種、抗性害虫出現、專利與小農生計、標籤與知情選擇。
基因治療:體細胞治療不遺傳,生殖細胞編輯則涉及未出生者的同意問題。
提醒:倫理題要「一項好處對一項風險」配對寫,不要只堆好處,閱卷員要找平衡。
04 必教題型與步驟
| 題型 |
例子 |
步驟 |
答案 |
| 排序 |
重組 DNA 步驟 |
剪貼送選驗,每步配一種酶 |
五步不可調亂 |
| 計算 |
重組質體長度 |
質體加插入片段 |
5.6000000000000005 kb |
| 讀圖 |
凝膠電泳判插入 |
先看 marker,再比條帶大小 |
1.2 kb 與 4.4 kb 兩帶 |
| 論證 |
基因改造作物評估 |
兩正兩反再加結論 |
要提基因漂移 |
合理性檢查(一定要教):重組質體一定比原質體長,所以酶切後其中一條帶要等於 1.2 kb;若兩條帶都比原質體短,說明酶切位點在質體內而不是插入片段兩側。凝膠上跑得最遠的一定是最小片段。
05 獨立練習三題
| 題目 |
答案 |
想觀察什麼 |
| 4.4 kb 質體插入 1.2 kb 後的總長 |
5.6000000000000005 kb |
直接相加 |
| 酶切重組質體後的兩條帶 |
1.2 kb 與 4.4 kb |
插入片段與載體骨架 |
| 200 個菌落來自 0.1 µg DNA 的轉化效率 |
2000 cfu/µg |
菌落數除以 DNA 量 |
06 學生常見錯誤與糾正句
| 錯誤 |
學生通常這樣寫 |
導師這樣說 |
| 把接合酶當限制酶 |
答「接合酶剪開質體」 |
「限制酶剪,接合酶貼,兩種酶方向相反。」 |
| 以為插入一定成功 |
見一條帶就說成功 |
「要見到插入片段那條帶才算,單一條帶可能只是原質體。」 |
| 混淆轉化與轉染 |
答「轉化是病毒感染」 |
「細菌吸收游離 DNA 叫轉化,轉染是導入動物細胞。」 |
| 倫理題只寫好處 |
列五個優點沒風險 |
「每寫一個好處就配一個風險,最後給一句有條件的結論。」 |
07 家課建議(直接指到練習卷題號)
08 離場檢查(最後 5 分鐘)
| 題目 |
答案 |
判定 |
| 4.4 kb 加 1.2 kb 的總長 |
5.6000000000000005 kb |
三題全對=可進生態章 |
| 重組質體酶切後有幾條帶 |
兩條 |
錯一題=下堂重講酶切圖 |
| 凝膠上哪個片段跑最遠 |
最小的片段 |
錯兩題以上=回到第一幕 |
09 導師常問
黏性末端為何重要?
互補的單鏈末端讓插入片段能與載體配對,接合酶才接得上。
為何要用抗生素抗性基因?
它是篩選標記,只有成功攝入質體的細菌才能在含抗生素的培養基生長。
PCR 為何需要引子?
引子提供 DNA 聚合酶的起始點,並界定要放大的片段兩端。
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